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总结了近年来国内外8种主要分子标记技术在红菇分类鉴定、遗传多样性及进化关系等方面的研究进展，介绍了IGS、ITS、LSU区域的标记技术以及限制性长度片段多态性（RFLP）、随机扩增片段多态性分析（RAPD）、扩增片段长度多态性（AFLP）、微卫星序列（SSR）和微卫星间隔序列（ISSR）等分子标记技术的原理和方法。