目的:分析秦艽种质资源主要生物学特性与龙胆苦苷含量的相关性。方法:基于已建立的高效液相色谱法测定收集的40份秦艽种质资源根中龙胆苦苷的含量,采用SPSS 16.0软件中的Spearman秩相关和回归分析中的最优尺度分析秦艽种质资源主要生物学特性与龙胆苦苷含量的相关性。结果:收集的40份秦艽种质根中龙胆苦苷的含量为7.56%~11.32%,龙胆苦苷含量和莲座叶叶形、顶端花序密度具有极显著的相关性,莲座叶的叶形越窄则根中龙胆苦苷的含量越高,顶端花序越密则根中龙胆苦苷含量越高;根中龙胆苦苷含量和花萼颜色、茎颜色具有显著相关性,颜色越深,龙胆苦苷含量越高。结论:以提高龙胆苦苷含量为目标选育优良单株时,莲座叶为披针形、顶端花序密集、花萼颜色和茎颜色为红色或红绿色的秦艽资源是主要选育对象。