随着社会的不断进步,经济的快速发展,对管理水平要求的不断提高,各级事业单位的主管机构包括自身对本单位内部控制的要求不断提高,建设也逐年明显加快。目前事业单位基本上财务内部控制体系已经初步建立。内部控制制度的重要性日益突出,对事业单位的管理工作也变得越来越重要,事业单位日常务管理工作要得到有效的控制离不开内控制的管理,而且还能够控制风险,保证自身良好的发展。但是根据本人日常观察的实际执行情况来看,财务内控制度在事业单位的日常工作应用中,还存在着一些问题需要完善,内控体系还缺乏一个比较系统、统一化的标准,所以这些薄弱环节一定程度上限制了事业单位的发展,导致财务信息效果未达预期。随着现如今我国体制内外方方面面的完善和发展,我们要通过自身去找出事业单位财务内部控制存在的问题,并且去完善其各项环节,然后加以改进,加强行政事业单位财务内控制度的完善,显得尤为必要。本文首先阐述了事业单位内部控制的概念、特殊性及其重要意义,然后对事业单位内部控制存在的内控意识相对不足、内控制度不够完善、岗位设置不合理、财务与业务管理互相脱节、内部控制环境不佳以及单位工作人员综合素质相对较低等问题进行了分析,并给出了解决对策。