一般来说，偶然性便秘(无器质性病变)对人体的影响不大：而慢性便秘，由于肠内容物长时间停滞于肠管内，经细菌作用引起发酵、腐败，产生大量的气体与毒物，常常可发生肠道性自体中毒现象。
　　一、食物残渣在结肠内发酵、腐败，产生大量的气体，如氮、二氧化碳、甲烷、吲哚、硫代氢等，致使肠管嘭胀。在肠膨胀时，肠壁的吸收及运动功能均受影响，此时，大量的气体不易由肠粘膜弥散入血，亦不易通过暖气、排气等排出体外，导致肠管进一步嘭胀，名谓“鼓肠”。鼓肠不仅使呼吸机能受限、静脉回流受阻，而且还可以反射性地引起循环和呼吸机能的改变，如心率先加快而后减慢，动脉压先升高而后下降，呼吸先快而后减慢，以及消化液分泌减少等。严重的鼓肠可因肠壁静脉受压迫而引起肠壁血液循环障碍，肠管运动进一步减弱，甚至发生肠麻痹。
　　二、肠内容物发酵腐败后，还可以产生大量毒性物质，如乳酸、醋酸、毒蕈碱、硫化氢、吲哚、腐胺、尸胺等。加之肠粘膜的屏障机能障碍和通透性增加，结果，大量毒物被吸收入血，进而引起自体中毒，尤以当肝脏的解毒机能低下时，中毒现象更为明显，病人可表现为精神淡漠、头晕、乏力、食欲减退、恶心、暖气等。当患者合并急性肠梗阻时，上述自体中毒的症状可以迅速出现且表现得很剧烈。
　　为了避免慢性便秘病人发生自体中毒，首先要注意消除便秘的病因，纠正经常用泻药或灌肠代替生理性排便的不良习惯，对顽固性便秘患者，可根据具体情况选用某些适当措施帮助病人排便。