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目的对一起霍乱暴发疫情中来自患者和甲鱼的O139群霍乱菌株分离株分子特征分析，判断传染来源。方法对疫情调查中的3株患者分离株和3株来自水产市场甲鱼标本的分离株，采用聚合酶链反应（PCR）检测分离菌株的毒力相关基因（ctxAB、toxR、zot）；用脉冲场凝胶电泳技术（PFGE）对菌株进行分子分型，所得结果以Bio-Numeric V4．0软件进行聚类分析。结果6株菌所有毒力相关基因全部阳性，均为产毒株。6株菌可得2个PFGE型，其中2株甲鱼株与3株患者株带型相同，1株甲鱼株独立成型。通过Pulse Net