甲肝减毒活疫苗L-A-1疫苗株的核酸序列测定与比较分析

来源 :中华实验和临床病毒学杂志 | 被引量 : 0次 | 上传用户:woyuxiandai
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目的 测定甲型肝炎(甲肝)减毒活疫苗龙甲-1株(L-A-1)核酸序列,了解其减毒和适应二倍体细胞的分子机制,并与其他甲肝病毒株进行比较,得出L-A-1株的一些特点.方法通过抗原捕获聚合酶链反应(AC-PCR)扩增甲肝病毒减毒活疫苗L-A-1株23代的片段,产物纯化后克隆至T载体并进行序列测定,应用生物信息学软件分析比较.结果得到了甲肝减毒活疫苗L-A-1株的基因序列(nt 25~7 418).L-A-1株开放读码框架(ORF)长6 675个核苷酸,编码2 225个氨基酸.比较分析表明,该株与国际代表株MBB株和HM 175野毒株在核苷酸水平上同源性分别为98.00%和94.00%,在氨基酸水平上同源性分别为98.51%和98.65%.通过与其他细胞适应株、细胞病变株以及减毒株的比较得出:A-1株5′非编码区(5′NTR)nt 152、591、646、687处的突变和180~181处插入11个核苷酸以及2B区的nt3 889(aa1 052-Val)处的突变是病毒适应宿主细胞的分子基础;2C区的nt 4 185(aa1 152-Lys)处的突变可能参与病毒的减毒过程;由于3A区缺失6个核苷酸(nt 5 020~5 025)从而导致两个氨基酸(Asn、Asp)缺失是病毒适应细胞快速增殖的分子基础.结论分析了L-A-1株的基因序列,得出其适应细胞和减毒的核苷酸位点。

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