【摘 要】
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目的 采用生物信息学及分子对接术探讨熊果酸治疗宫颈癌的分子靶点和作用机制.方法 运用TCMSP、DrugBank数据库检索熊果酸的疾病潜在靶点.在GeneCards及GEO数据库检索疾病“cervical cancer”,限定物种为“Homo sapiens”,通过分析筛选,得到GSE63514基因表达谱芯片数据,综合筛选得到熊果酸治疗宫颈癌的潜在靶点共39个.通过Cytoscape3.8.0软件下BisoGenet及CytoNCA插件创建靶点基因蛋白互作网络,并进行药物与疾病基因的GO和基因-KEGG通
【机 构】
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江汉大学 医学院,湖北 武汉 430056
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目的 采用生物信息学及分子对接术探讨熊果酸治疗宫颈癌的分子靶点和作用机制.方法 运用TCMSP、DrugBank数据库检索熊果酸的疾病潜在靶点.在GeneCards及GEO数据库检索疾病“cervical cancer”,限定物种为“Homo sapiens”,通过分析筛选,得到GSE63514基因表达谱芯片数据,综合筛选得到熊果酸治疗宫颈癌的潜在靶点共39个.通过Cytoscape3.8.0软件下BisoGenet及CytoNCA插件创建靶点基因蛋白互作网络,并进行药物与疾病基因的GO和基因-KEGG通路分析.利用AutoDock进行分子对接,预测熊果酸和疾病核心靶点的结合度,利用PyMOL软件绘图.结果 熊果酸治疗宫颈癌共39个潜在靶点,GO功能1171条,KEGG通路172条,筛选出与肿瘤相关的主要信号通路有:pathways in cancer、TNF signaling pathway、PI3K-Akt signaling pathway、p53 signaling pathway、apoptosis等.成功验证熊果酸小分子与RELA、JUN、CDKN1A、ICAM1、STAT3、NFKBIA基因的分子对接.结论 通过生物信息学等方法,揭示熊果酸通过抑制肿瘤细胞增殖、诱导细胞凋亡、抗血管生成及抗炎等相关基因及通路发挥多靶点和多通路的抗宫颈癌作用.
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