目的本研究对采自中国云南德宏、保山、西双版纳、普洱、红河和缅甸克钦邦、掸邦地区共90份鳄梨种资资源进行遗传多样性分析，为其新品种选育和种质创新提供参考依据。方法采用CTAB法提取鳄梨叶片基因组DNA，利用扩增片段长度多态性分子标记技术，对90份种质资源的基因组DNA进行酶切、连接、预扩增、选择性扩增，电泳分离，银染显色。电泳结果得到“0，1”矩阵，使用POPGENE 32软件计算每对引物的多态性条带、多态性比率、有效等位基因数、遗传多样性指数等指标，同时使用NTSYSpc-2.11F计算种质间遗传相似系数，根据相似性系数进行UPGMA聚类分析和PCA主效应分析，对鳄梨种质资源进行分类。结果从24对AFLP引物组合中，筛选出8对扩增条带清晰、多态性高的引物组合，8对引物共扩增出1 165个条带，其中多态性条带有1 163个，多态位点百分率为99.83%；有效等位基因数（Ne）平均1.294 4个；Nei’s基因多样性指数（H）平均0.209 5；Shannon信息指数（I）平均0.353 0。根据遗传相似系数进行聚类分析，在遗传相似系数0.752处可划分为4个类群，第I类群有1份保山种质70号；第II类群有24份种质；第III类群有1份西双版纳种质59号；第IV类群有64份种质。在遗传相似系数0.763处可将第IV类群划分为3个亚群（A、B和C）。用PCA法对90份鳄梨种质AFLP标记结果进行主效应分析，显示了不同种质的分类位置，主效应分析结果与分子聚类结果基本一致，呈一定的地域性分布规律。结论90份种质资源的遗传多样性较为丰富，59号和70号相对特殊，在种质创新中应给予重点关注。