一种新的比较分子/虚拟受体相互作用分析法

来源 :科学通报 | 被引量 : 0次 | 上传用户:YY_SQYZ
下载到本地 , 更方便阅读
声明 : 本文档内容版权归属内容提供方 , 如果您对本文有版权争议 , 可与客服联系进行内容授权或下架
论文部分内容阅读
将虚拟受体的概念与比较分子场法有机结合起来,得到了一种新颖的3D-QSAR研究方法:比较分子/虚拟受体相互作用分析法(CoMPIA).该方法通过定义受体原子探针并利用遗传算法优化探针在药物分子周围的最佳分布情况来找寻模型最优解和虚拟受体模式,从而有效提高了建模的质量和结果的可解释性.使用CoMPIA对31个经典甾体化合物进行了系统的QSAR研究,所得模型拟合复相关系数R2、交叉检验Q2以及对测试集预测结果的均方根误差RMSEF,分别为0.940,0.868和0.502,该结果优于多数文献报道. By combining the concept of virtual acceptor with the comparative molecular field method, a novel 3D-QSAR method was developed: the comparative molecular / virtual receptor interaction analysis (CoMPIA). The method can find the optimal model and the virtual receptor model by defining the receptor atom probe and using the genetic algorithm to optimize the best distribution of the probe around the drug molecule, so as to effectively improve the quality of modeling and the interpretability of the result Sex. A systematic QSAR study of 31 classical steroids was performed using CoMPIA. The resulting model fitted the complex correlation coefficient R2, the cross-test Q2, and the root-mean-square-root-mean-square error RMSEF for the test set, respectively, at 0.940 and 0.868, respectively And 0.502, which is better than most reports.
其他文献
针对银行操作风险损失分布的厚尾性和损失事件之间的尾部相依性,首先用单变量极值理论建立了单个损失事件计量模型,然后用多变量极值的连接函数反映了损失事件之间的尾部相依
目的通过小分子干扰RNA(siRNA)对Her-2基因表达的影响,探讨其对卵巢上皮性癌(卵巢癌)细胞生物学行为的影响。方法针对Her-2基因的siRNA质粒和阴性对照质粒在脂质体介导下转染
为解决2n名选手循环赛安排问题.给出了边矩阵及循环赛图的定义.提出了求K2n的△(G)个完备匹配M(i)的一种算法.介绍了8名选手循环赛图K(1)8及16名选手循环赛图K(1)16的形成过
高速道岔是高速铁路轨道结构的关键,其结构与状态对列车运行安全和运行品质具有重大影响.本文结合盘营客专线首组高速道岔铺设方案进行研究,为以后的高速道岔铺设提供方案.
采用传统的方法用外径千分尺在圆直径两端切点处测量出租汽车计价器标准装置主滚轮直径显然不适合现场在线(不拆卸)检定.本文介绍用长春金凯达科技有限公司生产的PI000 -Ⅱ型
基于GOALS模型的基本思想,建立了效果分析模型,并针对两种不同的资金分配方案,模拟了两种方案对2006-2010年某地艾滋病流行的影响,并对模拟结果进行了分析.
设计了聚合物硅基并联10环阵列微环谐振滤波器,优化了并联多环谐振器的环数,并给出了光强传递函数的通用公式.根据数值模拟结果,优化了波导尺寸、谐振级数、相邻微环的圆心间
研发的超快电子衍射系统由超快电子枪、样品室、超快读出系统、电源系统,以及真空系统等组成,该超快电子衍射系统具有较高的时间分辩能力和较强的探测能力.光电阴极是蒸镀于M
研究了当保费率随理赔强度的变化而变化时C ox风险模型的折现罚金函数,利用后向差分法得到了折现罚金函数所满足的积分方程,进而得到了破产概率,破产前瞬时盈余、破产时赤字
提出一种变量非线性反馈(VNF)方法控制混沌系统.介绍了该方法的控制原理以及反馈系数的选取原则,以单模激光Haken-Lorenz系统为例对非线性反馈控制方法进行了理论研究.仿真结