【摘 要】
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基于生物信息学的手段从免疫浸润角度分析肝癌患者的性别和预后生存关系的差异.从TCGA数据库中的肝癌和正常组织的免疫浸润微阵列数据、TMB数据,使用CiberSort软件提取其中的
【机 构】
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西南医科大学基础医学院,四川泸州646000;大理大学基础医学院,云南大理671000;云南省昆虫生物医药研发重点实验室,云南大理671000
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基于生物信息学的手段从免疫浸润角度分析肝癌患者的性别和预后生存关系的差异.从TCGA数据库中的肝癌和正常组织的免疫浸润微阵列数据、TMB数据,使用CiberSort软件提取其中的免疫细胞基因信息,并进行肝癌患者性别和预后生存关系的差异分析.发现肝癌微环境中的免疫激活可能更多来自活化NKT细胞且与预后有关,并有显著的性别差异;同时微环境免疫抑制可能与肝癌组织中巨噬细胞Ml被显著抑制有关.此外,本研究还发现男性肝癌患者中记忆B细胞、活化NK细胞、DC细胞均较女性少,提示男女肝癌发病以及预后差异的原因是性激素影响肝癌组织的特异性以及体液免疫细胞的差异性激活导致的.此外,研究了肝癌突变负荷(TMB)性别差异情况,分析结果显示TMB和男性生存预后明显相关,却和女性不相关.对男女性特有的15个下调和82个上调的差异基因进行DAVID富集分析,发现与男性生存明显相关的下调特异基因是DACH1,上调特异基因是VLDLR和SOX2,这些肿瘤差异基因可以和募集来的免疫细胞相互作用,从而改变肿瘤微环境,导致男女性的发病率和预后差异.
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