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目的：分析心源性脑栓塞患者应用两种溶栓方法治疗的有效性及安全性。方法：随机选择2013年8月-2015年8月在本院接受治疗的心源性脑栓塞患者60例参与研究，随机平均分成2组，对照组患者选择静脉溶栓治疗，观察组选择单纯动脉溶栓治疗，比较两组治疗效果。结果：观察组治疗后FS、LVEF、LVEDd果均优于对照组；观察组治疗后NIHSS和GCS评分为（9.2±5.2）分、（14.1±4.7）分，对照组（12.4±6.2）分、（11.2±5.6）分。结论：动脉溶栓治疗较静脉溶栓治疗的效果更为明显，能够改善患者神经功能缺损状态，值得推广。