【摘 要】
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In the nucleus, chromatin is folded into hierarchical architecture that is tightly linked to various nuclear functions. However, the underlying molecular mechan
【机 构】
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MOE Key Laboratory of Metabolism and Molecular Medicine,Department of Biochemistry and Molecular Bio
【出 处】
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基因组蛋白质组与生物信息学报（英文版）
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In the nucleus, chromatin is folded into hierarchical architecture that is tightly linked to various nuclear functions. However, the underlying molecular mechanisms that confer these archi-tectures remain incompletely understood. Here, we investigated the functional roles of H3 lysine 9 dimethylation (H3K9me2), one of the abundant histone modifications, in three-dimensional (3D) genome organization. Unlike in mouse embryonic stem cells, inhibition of methyltransferases G9a and GLP in differentiated cells eliminated H3K9me2 predominantly at A-type (active) genomic compartments, and the level of residual H3K9me2 modifications was strongly associated with B-type (inactive) genomic compartments. Furthermore, chemical inhibition of G9a/GLP in mouse hepatocytes led to decreased chromatin-nuclear lamina interactions mainly at G9a/GLP-sensitive regions, increased degree of genomic compartmentalization, and up-regulation of hundreds of genes that were associated with alterations of the 3D chromatin. Collectively, our data demonstrated essential roles of H3K9me2 in 3D genome organization.
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