茶陵野生稻冷响应基因OrCrZFl的克隆与生物信息学分析

来源 :激光生物学报 | 被引量 : 0次 | 上传用户：nesecueity

【摘要】

：

OrCrZFl基因是基于水稻基因表达芯片分析从茶陵野生稻中筛选出的一个受低温诱导、编码类锌指蛋白的基因。以茶陵野生稻为材料,用RT-PCR方法扩增获得了包含其完整ORF的cDNA克

【作者】

：

盛丽丽龚曼屠思雨莫香丁绿萍徐孟亮崔延春

【机构】

：

湖南师范大学生命科学学院,中国科学院亚热带农业生态过程重点实验室

【出处】

：

激光生物学报

【发表日期】

：

2019年6期

【关键词】

：

野生稻冷逆境基因克隆生物信息学 Oryza rufipogon cold stress gene cloning bioinformatics

【基金项目】

：

湖南省重点科技计划项目(2012FJ2013),中国科学院亚热带农业生态过程重点实验室开放基金项目(ISA2015201),湖南省自然科学基金项目(2018JJ3343),湖南省教育厅重点科研项目(19A289)

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OrCrZFl基因是基于水稻基因表达芯片分析从茶陵野生稻中筛选出的一个受低温诱导、编码类锌指蛋白的基因。以茶陵野生稻为材料,用RT-PCR方法扩增获得了包含其完整ORF的cDNA克隆。根据其ORF进行预测,该基因编码一个包含492个氨基酸残基的蛋白,其理论分子量为51.895 kD,pI=6.21。经蛋白质相似性比对,其编码蛋白与日本晴第8号染色体上Os08g0536300基因编码的蛋白质(GenBank登录号:XP_015649825.1,zinc finger protein CONSTANS-LIK

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