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[目的]通过对黄芪种子进行rRNA基因内转录间隔区碱基序列的测定，建立其分子水平的鉴定标记。[方法]以改良CTAB法提取黄芪种子DNA，利用合成的通用引物对其rRNA基因内转录间隔区进行nPCR扩增，将扩增产物进行碱基序列测定。[结果]琼脂糖凝胶电泳证实黄芪种子中rRNA基因内转录间隔区PCR扩增产物存在，经测序后得到了黄芪种子rRNA基因内转录间隔区的碱基序列。[结论]rRNA基因内转录间隔区碱基测序技术可作为分子水平鉴定植物性中药材的又一有效途径。