【摘 要】
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目的研究16S～23S rDNA内转录间隔区(internal transcribed spacer,ITS)序列在分支杆菌鉴定中的应用价值.方法应用PCR-直接测序法对22种30株分支杆菌参考菌株和16株分支杆菌临
【机 构】
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100091,北京,解放军第三○九医院结核病研究室;中国药品生物制品检定所;上海市疾病预防控制中心
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目的研究16S～23S rDNA内转录间隔区(internal transcribed spacer,ITS)序列在分支杆菌鉴定中的应用价值.方法应用PCR-直接测序法对22种30株分支杆菌参考菌株和16株分支杆菌临床分离菌株16S～23SrDNA ITS 测序.对所测定序列以及GenBank所报道的有关序列用Clustal程序(MegAlign Package [Windows Version 4.01];DNASTAR,Madson,Wis)处理分析,计算种间相似性,用PHYLIP Package构建分支杆菌菌种聚类分析树状谱.结果除结核分支杆菌复合群(MTC)菌种(结核分支杆菌、牛分支杆菌、非洲分支杆菌和田鼠分支杆菌)16S～23S rDNA ITS序列完全一致外,其它分支杆菌菌种间核苷酸排列顺序及长度变异较大,种间相似性为30.4%～86.5%,聚类分析树状谱能将各分支杆菌菌种相分离.结果表明16S～23S rDNA ITS序列分析能将MTC与非结核分支杆菌(NTM)相鉴别,能将NTM鉴定至种的水平.结论 16S～23S rDNA ITS可做为分支杆菌鉴定的靶基因.
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