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中子脉冲序列频谱分析是一种极为重要的核信息随机信号分析方法。论文针对中子脉冲序列信号本身所具有特殊的“0、1”结构特点，构造了旋转因子表，通过加法和寻址运算及SSE优化指令，实现了在1GHz采样率下基于PC平台的中子脉冲序列信号的FFT实时频谱分析。性能测试及仿真验算结果表明，在中子计数率为3×10^6s^-1时，该算法所需的计算时间较相应的FFTW提高了355．3％，满足了中子脉冲序列信号频谱分析的实时性要求，且还具有可扩展性强、维护方便等优点。