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研究2014年上海市手足口病的病原谱，及肠道病毒A组7l型(EV-A71)和柯萨奇病毒A组16型(CV-A16)变异变迁规律。
方法采集上海市2014年手足口病患者的咽拭子标本，进行核酸检测，对核酸检测结果为EV-A71、CV-A16以及其他EV阳性的临床标本进行病毒分离。对病毒分离结果阳性株进行全长VP1编码区基因的扩增以及核苷酸序列的测定和分析，然后与EV-A71、CV-A16各基因型和基因亚型的代表株构建亲缘性进化树。
结果2014年上海市辖区共对2017例HFMD临床标本进行了核酸检测，共有1 644例检测结果为阳性。从中随机地选择出75份临床标本接种RD细胞和Vero细胞，共有60份出现EV特征性CPE，病毒分离的阳性率为82.67%，其中23株被鉴定为EV-A71、32株被鉴定为CV-A16、5株被鉴定为其他EV。23株EV-A71全部属于C4a进化分支；32株CV-A16中，有8株属于B1a进化分支，有24株属于B1b进化分支。
结论2014年上海市辖区手足口病呈现EV-A71与CV-A16共同流行的模式。C4a进化分支的EV-A71在上海市持续传播，而B1b进化分支成为上海市CV-A16的流行优势株。研究和掌握EV-A71和CV-A16等肠道病毒流行株的基因特征，发现其变异位点和变异趋势，对HFMD预防控制策略措施的制定将有重要的参考意义。