多发与单发性胶质瘤患者石蜡包埋组织中微小RNA差异表达的初步探讨

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目的

比较多发与单发性胶质瘤甲醛固定石蜡包埋(FFPE)组织中微小RNA(miRNA)表达谱的差异,初步探讨差异表达的miRNA及其靶基因在胶质瘤侵袭迁移中可能发挥的作用。

方法

选取多发和单发胶质瘤患者FFPE标本各6例,提取总RNA并进行质检;采用基因芯片技术检测miRNA表达谱,利用芯片分析软件对结果进行数据分析,筛选出多发与单发胶质瘤表达差异有统计学意义的miRNA,再利用生物学信息库预测表达差异最显著miRNA的靶基因。

结果

所有FFPE组织标本中提取的总RNA质量均符合质控标准。与单发胶质瘤相比,多发胶质瘤中共有128个miRNA表达差异有统计学意义(倍数>2或<0.5),其中有10个miRNAs显著上调(倍数>50),分别为miR-21、miR-455、miR-199、miR-410、miR-148a、miR-335、miR-34b、miR-664a、miR-542、miR-4453;有5个表达明显下调(倍数<0.05),分别为miR-200a、miR-451、miR-29a、miR-101、miR-96。基于上调和下调最显著的miR-21(差异倍数为240.11)和miR-200a(差异倍数为0.009913)靶基因预测结果,其多种靶基因涉及肿瘤侵袭迁移相关的生物学功能。

结论

FFPE组织可以满足后续miRNA芯片等实验研究。多发胶质瘤与单发胶质瘤存在miRNA的差异表达,其中miR-21和miR-200a可能与胶质瘤的侵袭和迁移密切相关。

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