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目的：采用衰减全反射-傅里叶变换红外光谱（ATR-FTIR）技术检测急性心肌缺血猝死大鼠的血清分子特征，探讨二维红外光谱鉴别急性心肌缺血猝死的法医学价值。方法成年雄性SD大鼠随机分为急性心肌缺血猝死组（实验组）和空气栓塞死组（对照组），血清样本行ATR-FTIR检测，应用OMNIC软件进行光谱预处理并求二阶导数光谱，分别计算两组原始光谱及二阶导数光谱的相似度，并应用Matlab R2010a软件建立二维光谱模型。结果实验组与对照组的大鼠血清的原始红外光谱在峰形、峰位、峰强度均极其相似，相似度达99.78%，二阶导数光谱显示出两者相似度降至98.62%，二维光谱模型显示两组光谱在1625cm-1、1550cm-1、1080cm-1及860cm-1附近的成分差异，且它们的自动峰个数不相同，提示两组在蛋白质、糖原、核酸等分子含量存在较明显差异。结论仅从一维光谱上难以区分出两组的分子差异，二维红外光谱可以直观、有效地反映出急性心肌缺血猝死与空气栓塞死的大鼠血清分子差异，有望应用于法医学死因鉴别。