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复杂疾病的遗传流行病学研究是近年来研究的热点，通过全基因组扫描获得了大量复杂疾病的易感区域，下一步重点是通过候选基因的方法对该区域的基因进行关联性的分析，传统的关联性分析是通过病例对照研究设计，但不能避免人口混杂造成的虚假关联。以家系为基础的关联性分析成为候选基因的重要研究方法，由于家系资料的数据库结构、模型选择、分析指标不同于传统的病例对照研究，需要特定的遗传统计分析软件来完成。