棘孢木霉(Trichoderma asperellum)几丁质酶基因的克隆与生物信息学分析

来源 :中国生物化学与分子生物学报 | 被引量 : 0次 | 上传用户:xym1013
下载到本地 , 更方便阅读
声明 : 本文档内容版权归属内容提供方 , 如果您对本文有版权争议 , 可与客服联系进行内容授权或下架
论文部分内容阅读
几丁质酶作为木霉菌防治植物病虫害的主要因子,在生物防治和环境保护等领域发挥着重要的作用.为了研究棘孢木霉(Trichoderma asperellum)的生防机制并获得与其相关的功能基因,本研究通过RT-PCR、3’-RACE及5’-TAIL-PCR技术克隆了T.asperellum 1个几丁质酶基因Tachi1,对该基因进行了生物信息学分析,并利用毕赤酵母表达系统进行表达验证.Tachi1的DNA序列长1 635 bp,含有3个内含子,包含1 275 bp的开放阅读框,编码424个氨基酸;Tachi1属于糖基水解酶18家族内切几丁质酶,包含SIGGW底物结合位点和FDGIDXDWE活性中心位点,信号肽长度为22个氨基酸,成熟肽分子量为44 kD,二级结构以α-螺旋、β-折叠和无规则卷曲为结构元件,三级结构为(α/β)8的圆桶形结构.转Tachi1基因酵母工程菌可高效分泌表达几丁质酶Tachi1,甲醇诱导培养8 d几丁质酶酶活可达9.25 U/mL. Chitinase plays an important role in the prevention and control of plant diseases and insect pests as Trichoderma.In order to study the mechanism of biocontrol of Trichoderma asperellum and obtain the related functional genes, In this study, a chitinase gene Tachi1 of T.asperellum was cloned by RT-PCR, 3’-RACE and 5’-TAIL-PCR. Bioinformatic analysis of this gene was carried out. The Pichia pastoris expression system The Tachi1 DNA was 1635 bp in length and contained 3 introns, including an open reading frame of 1 275 bp, encoding 424 amino acids. Tachi1 belongs to the endo-chitinase of glycosyl hydrolase 18 family and contains SIGGW substrate binding site and FDGIDXDWE active site, the signal peptide is 22 amino acids in length and the mature peptide has a molecular weight of 44 kD. The secondary structure is composed of α-helix, β-sheet and random coil. The tertiary structure (Α / β) 8. The Tachi1 gene yeast engineered bacteria can efficiently express chitinase Tachi1, and the methanol-induced chitinase activity reached 9.25 U / mL for 8 days.
其他文献
开展临床药学,做好合理用药工作已成为医院药学首要任务。临床药师深入临床第一时间了解患者的病情变化,参与并协助医师制定个体化给药方案,观察药物治疗后的反应。以下以1例
目的 :探讨缺铁性贫血导致感音神经性聋的治疗方法及疗效。方法 :将 6 8只 Wistar大鼠分成 3组 :48只通过缺铁饮食制作缺铁性贫血模型 ,缺铁 A组和 B组各 2 4只 ;另设标准对
分析了磁轮切割机车体的运动机理,并建立了相应的数学模型.此模型可采用定时插补法处理,以协调控制两轮行走,便于实现现场自动切割. The movement mechanism of magnetic wheel c
作文教学是语文教学中的重要部分,却也是一个薄弱环节.《课程标准》对写作有明确要求,筛选出自己学生在哪方面存在问题,制定目标,进行强化训练.本文就作文教学中存在的问题,
邓小平同志有两句经典的富民富国名言,第一句是让一部分地区一部分人先富起来,第二句是实现共同富裕。1985年10月23日邓小平在会见美国企业家时说:“当然,一部分地区、一部分
In human nephrolithiasis, most stones are containing calcium and are located within urinary cavities; they may contain monohydrate calcium oxalate, dihydrate ca
观察头针、颞三针、体针配合脑活素、北芪注射液穴位注射治疗60例小儿脑性瘫痪患者,总有效率85%。结果显示:疾病类型与疗效差异无显著性意义(P>0.05),各类型小儿脑性瘫痪均可采用本法治疗;各发
从徒手创业到如今高达23亿的身价,再到市值3000亿台币的鸿海帝国,郭台铭并不觉得有多么不可思议,即将退隐江湖的他有着鲜为人知的一面,正所谓一半是天使一半是魔鬼。 From a
人在打哈欠的时候大多数人的第一反应就是身体给我们的疲劳、困倦的信号,但是很少有人知道,打哈欠与唱歌还有很大的关系。唱歌是一门艺术,是歌唱者对于自己情感的表达,歌唱者
我国第一家利用国外技术达到规模生产大型客车底盘的浙江省杭州市东风日产柴汽车有限公司,近日投入生产和销售。合资公司由东风汽车公司、日本日产柴汽车工业株式会社、日本