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在对湖泊生态系统健康评估的研究的基础上，选用乌梁素海物理化学指标（SD、DO、COD、NH3-N、BOD、TN、TP）数据及生物指标（浮游植物数量、浮游动物数量、底栖动物生物量、水生植物覆盖度、浮游植物叶绿素a）数据等12项指标，利用指标体系法计算乌梁素海生态健康综合指数，结果表明：乌梁素海生态系统综合健康指数总体上呈现明显递减趋势，表明其系统健康状况整体呈下降趋势。该结果客观地反映了乌梁素海近些年来的生态系统的健康状况，为乌梁素海的管理提供了科学依据，为湖泊生态安全调查奠定了基础。