【摘 要】
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目的:运用高通量测序数据对妊娠期糖尿病(gestational diabetes mellitus,GDM)患者生物信息进行分析,探讨GDM对胎儿基因表达的影响.方法:NCBI网站GEO数据库获取GDM患者胎儿脐
【机 构】
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安阳市妇幼保健院检验科,河南安阳 455000;安阳市妇幼保健院病理产科,河南安阳 455000
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目的:运用高通量测序数据对妊娠期糖尿病(gestational diabetes mellitus,GDM)患者生物信息进行分析,探讨GDM对胎儿基因表达的影响.方法:NCBI网站GEO数据库获取GDM患者胎儿脐带组织高通量测序数据,建立条件筛选差异表达基因(differentially expressed genes,DEGs),使用DAVID在线工具分析DEGs相关的生物过程与生物信号传导通路,使用STING在线工具分析GEGs编码蛋白之间的相互关系(protein protein interaction,PPI),并筛选出候选基因.选取60名GDM患者(实验组)与GDM名正常孕妇(对照组)脐带组织,利用实时荧光定量PCR技术(real-time fluorescent quantitative PCR,qRT-PCR)验证候选基因的表达.结果:共计113个DEGs满足筛选条件,其中低表达基因30个,高表达基因83个.PPI分析确定19个基因为可能的候选基因.经qRT-PCR验证,实验组HLA-DRB5基因表达显著低于对照组,差异有统计学意义(P<0.01),实验组ALDH1A2、SLC4A1、TP63基因显著高于对照组,差异有统计学意义(P<0.01).结论:GDM患者高糖环境导致胎儿脐带基因表达差异,胎儿生长发育可能受差异表达基因影响,检测GDM患者胎儿脐带基因表达有望为揭示胎儿生长发育异常提供科学依据.
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