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西印度洋海洋科学协会（Western Indian Ocean Marine Science Association，简称WIOMSA）是一家致力于推动西印度洋地区海洋科学各个方面的教育、科学和技术发展的非政府组织，成立于1991年12月，协会秘书处设置于坦桑尼亚桑给巴尔的达累斯萨拉姆大学海洋科学学院。