【摘 要】
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剪切后的内含子在基因表达和调控过程中发挥重要作用,由此在成熟mRNA与相应的内含子之间也存在相互作用,并且二者协同进化。为了验证这一理论,以13个物种的基因组作为研究样
【机 构】
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内蒙古农业大学理学院,内蒙古医科大学计算机信息学院,内蒙古自治区农牧业科学院
【基金项目】
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内蒙古农业大学博士科研启动基金(No.NDYB2016-13),内蒙古农业大学基础学科科研启动基金(No.JC2017003),国家自然科学基金(No.11747084),内蒙古自然科学基金(No.2018BS03001)
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剪切后的内含子在基因表达和调控过程中发挥重要作用,由此在成熟mRNA与相应的内含子之间也存在相互作用,并且二者协同进化。为了验证这一理论,以13个物种的基因组作为研究样本,凭借Smith-Waterman的局域比对方法,最终得到在成熟mRNA与其内含子序列之间的最佳匹配片段,同时在mRNA序列上显示出最佳匹配强度的分布区。然后对最佳匹配片段的长度、配对率的分布这两项参数进行分析之后,发现最佳匹配片段的这两个参数的特征,与siRNA和miRNA的结合特征是相近的;在mRNA序列上,得出UTR区与内含子相互作
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