【摘 要】
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bZIP转录因子调控着植物的生长发育和逆境胁迫应答,是植物中一类重要的转录因子。基于系统的生物信息学方法,鉴定得到79个中华猕猴桃bZIP转录因子,进化分析结果揭示中华猕猴桃bZ
【机 构】
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三江源生态与高原农牧业国家重点实验室/青海大学农林科学院作物育种栽培研究所/农业农村部作物基因资源与种质创新青海科学观测试验站/国家作物种质复份库; 合肥工业大学食品与生物工程学院;
【基金项目】
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国家自然科学基金青年科学基金(31760383,31440028);青海省科技厅科技平台建设项目(2017-ZJ-Y41);物种资源保护项目(19190170)资助
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bZIP转录因子调控着植物的生长发育和逆境胁迫应答,是植物中一类重要的转录因子。基于系统的生物信息学方法,鉴定得到79个中华猕猴桃bZIP转录因子,进化分析结果揭示中华猕猴桃bZIP家族成员在J、K、L三个分组中出现了成员的缺失。中华猕猴桃bZIP家族成员的bZIP保守域主要由碱性结构域和亮氨酸拉链结构域组成,其亮氨酸拉链结构域的第4、5肽段的第7位的亮氨酸残基存在一定程度的变异。bZIP保守域之外,在中华猕猴桃的18个bZIP家族成员中,还发现包括bZIP_C保守域在内的8种其它类型的保守域,集中分布在A、C、D和G组bZIP成员中。通过与葡萄和番茄bZIP同源基因的比较,阐明中华猕猴桃基因组的两次三倍倍增是其bZIP基因数目增加的主要原因。中华猕猴桃不同发育时期果实的转录组,揭示了参与调控果实成熟的57个bZIP基因的表达水平。本研究阐明了中华猕猴桃bZIP家族成员的进化特征、保守域组成、家族成员数目扩增的主要原因,提供了涉及果实发育的优良候选基因。
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