【摘 要】
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利用Illumina Miseq测序技术,对健康与患根腐病草莓根际土壤、非根际土壤及根内真菌ITS区的rRNA进行扩增和高通量测序,分析不同部位样品真菌群落结构与多样性.结果表明:健康组共鉴定出14个门、40个纲、99个目、211个科、377个属、561个种的真菌;患根腐病组共鉴定出14个门、39个纲、98个目、238个科、385个属、570个种的真菌.患根腐病草莓根际土壤真菌群落丰富度、多样性和均匀度高于健康草莓,非根际土壤及根内真菌群落丰富度、多样性和均匀度均低于健康草莓.健康与患根腐病草莓根际与非根
【机 构】
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漳州市农业科学研究所,福建漳州 363005
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利用Illumina Miseq测序技术,对健康与患根腐病草莓根际土壤、非根际土壤及根内真菌ITS区的rRNA进行扩增和高通量测序,分析不同部位样品真菌群落结构与多样性.结果表明:健康组共鉴定出14个门、40个纲、99个目、211个科、377个属、561个种的真菌;患根腐病组共鉴定出14个门、39个纲、98个目、238个科、385个属、570个种的真菌.患根腐病草莓根际土壤真菌群落丰富度、多样性和均匀度高于健康草莓,非根际土壤及根内真菌群落丰富度、多样性和均匀度均低于健康草莓.健康与患根腐病草莓根际与非根际土壤样品的优势菌门均为子囊菌门、被孢霉门和担子菌门,根内样品的优势菌门均为子囊菌门和担子菌门;患根腐病草莓根际土壤、非根际土壤及根内样品的子囊菌门和担子菌门相对丰度均高于健康草莓,被孢霉菌门相对丰度均低于健康草莓.患根腐病草莓根际和非根际土壤的优势属均为帽状菌属和被孢霉属,健康草莓根际和非根际土壤的优势属均为玛利亚霉菌属和被孢霉属.患根腐病草莓根际土壤被孢霉属相对丰度比健康草莓增加2.26％,而非根际土壤被孢霉属比健康草莓减少1.63％.健康和患根腐病草莓根内样品优势属均为帽状菌属和玛利亚霉菌属,患根腐病草莓根内玛利亚霉菌属比健株减少7.53％.健康与患根腐病草莓根际土壤、非根际土壤及根内真菌群落组成差异明显,说明草莓根腐病的发生与田间土壤及根内真菌群落结构改变密切相关.
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