【摘 要】
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目的:针对儿童重症疟疾中脑疟疾患儿外周血的基因表达谱,核心基因的筛选及生物学功能的初步探讨.方法:GEO数据集中GSE1124(5个正常儿童及4个脑疟疾患儿)的数据,利用R语言,DAV
【机 构】
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贵州医科大学寄生虫学教研室 贵州 贵阳 550004
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目的:针对儿童重症疟疾中脑疟疾患儿外周血的基因表达谱,核心基因的筛选及生物学功能的初步探讨.方法:GEO数据集中GSE1124(5个正常儿童及4个脑疟疾患儿)的数据,利用R语言,DAVID及STRING等生物信息学方法进行差异表达,功能富集及网络互作的分析.结果:共获得941个差异基因,其中446个上调,495个下调,主要富集T细胞分化,Notch信号通路的调控,前脑神经元的生成,呼吸链复合物IV,JAK-STAT signaling pathway和钙离子信号通路等,最后筛选到10个核心基因.结论:脑疟疾的发生发展可能受到RPS7,RPS24,RPS29,EGFR,RPL34,RPL22L1,RPL7,EIF3B,ELAVL1,SOCS3的调控.
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