【摘 要】
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目的:探究特发性肺动脉高压(IPAH)患者的外周血单核细胞差异表达基因及相关信号通路,为进一步研究和临床诊疗提供新的靶点.方法:通过GEO数据库获取GSE33463基因芯片数据集,筛选特发性肺动脉高压(IPAH,30例)作为研究组,分别与对照组(41例)和系统性硬化病相关肺动脉高压组(SSc?PAH,42例)进行比较分析.采用R软件和GEO2R工具筛选差异表达基因,并进行GO基因本体分析、KEGG信号通路分析和蛋白质相互作用分析.结果:与对照组相比,IPAH组外周血单核细胞共筛选33个上调基因和51个下调
【机 构】
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汕头市中心医院 中山大学附属汕头医院 心血管内科,广东 汕头515031
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目的:探究特发性肺动脉高压(IPAH)患者的外周血单核细胞差异表达基因及相关信号通路,为进一步研究和临床诊疗提供新的靶点.方法:通过GEO数据库获取GSE33463基因芯片数据集,筛选特发性肺动脉高压(IPAH,30例)作为研究组,分别与对照组(41例)和系统性硬化病相关肺动脉高压组(SSc?PAH,42例)进行比较分析.采用R软件和GEO2R工具筛选差异表达基因,并进行GO基因本体分析、KEGG信号通路分析和蛋白质相互作用分析.结果:与对照组相比,IPAH组外周血单核细胞共筛选33个上调基因和51个下调基因.上调基因中HBD、NFE2、HBE1、HBG1、EPB42、SELENBP1、AHSP、SNCA、ALAS2、HBG2、HBQ1和HBM共12个基因为枢纽基因,主要参与血红蛋白复合体组成、氧转运蛋白活性调节、氧输送、氧结合等生物学过程.下调基因中JUNB、JUN、NFKBIA和FOSB4为枢纽基因,主要参与AP?1转录因子信号传导、对激素刺激反应等生物学过程.与SSc?PAH组相比,IPAH组共筛选出1个上调基因(RBPMS2)和18个下调基因,下调基因中OAS2、OAS3、IFI6和IFITM3作为枢纽基因参与免疫反应过程.结论:IPAH患者外周血单核细胞的红系基因表达上调和AP?1信号传导下调可能在IPAH的发生发展过程中发挥重要作用,可以作为进一步临床研究的方向.OAS2、OAS3、IFI6和IFITM3基因可能有助于IPAH与SSc相关肺动脉高压的鉴别诊断.
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