【摘 要】
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目的分析黑龙江省HIV-1感染者中流行株CRF01_AE env基因序列特征以及成簇特性。方法应用巢式聚合酶链反应(Nested polymerase chain reaction ，Nested-PCR)对env C2-C4区核苷酸序列进行扩增。用MEGA软件进行系统进化分析，然后对156份CRF01_AE重组型HIV-1毒株env基因V3环及邻近区域氨基酸特征分析以及生物信息学分析。结果156
【机 构】
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150081 哈尔滨医科大学药学院，哈尔滨医科大学基因组中心,150081 哈尔滨医科大学药学院，哈尔滨医科大学基因组中心,150081 哈尔滨医科大学药学院，哈尔滨医科大学基因组中心,150081
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目的分析黑龙江省HIV-1感染者中流行株CRF01_AE env基因序列特征以及成簇特性。
方法应用巢式聚合酶链反应(Nested polymerase chain reaction ，Nested-PCR)对env C2-C4区核苷酸序列进行扩增。用MEGA软件进行系统进化分析，然后对156份CRF01_AE重组型HIV-1毒株env基因V3环及邻近区域氨基酸特征分析以及生物信息学分析。
结果156份样本中绝大多数样本与中国黑龙江、吉林、辽宁的代表毒株聚成一簇，还有一小部分样本与来自中国云南以及泰国代表株90CM240、90CM235聚成一簇。共发现6种V3环顶端四肽类型，主要类型为GPGQ、GPGR，此外还有GLGR、GQGR、GPGK、GPGS。根据V3环的氨基酸分析可预测HIV-1辅助受体的使用情况，其中121份(77.6%)使用趋化因子受体5(chemokine reseptor，CCR5)作为辅助受体，没有可被预测为使用趋化因子受体4[chemokine(c-x-c matif)-receptor 4，CXCR4]为辅助受体的毒株，35份(22.4%)样本不能被预测。以bootstrap≥90%、基因距离≤0.045作为界定传播簇的参数，共形成16条传播簇，其中1条传播簇有9条序列。
结论黑龙江省HIV-1流行株CRF01_AE V3环顶端四肽具有较大的变异性，大部分毒株呈现巨噬细胞嗜性。CRF01_AE毒株形成的传播簇规模较小，成簇序列数也仅达到四分之一。
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