产耐有机溶剂糖苷酶菌株的筛选与鉴定

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  摘要:本文采集化工厂附近被污染土壤,经过富集培养、初筛和復筛,得到一株产耐有机溶剂β-葡萄糖苷酶的革兰氏阳性菌株,并命名为ZXS,经鉴定该菌为Enterobacter cloacae(阴沟肠杆菌)。该菌在温度35 ℃,pH为7.0,DMF含量10%的条件下,β-葡萄糖苷酶活力最高,可达24.7 U/L。
  关键词:耐有机溶剂;糖苷酶;筛选;鉴定
  中图分类号:Q556 .2 文献标识码:A 文章编号:1003-2177(2018)02-0093-04
  糖苷酶(Glycoside hydrolases, GH, EC 3.2.1),又称糖苷水解酶,广泛存在于生物体中[1-2],在自然界糖苷键的水解过程中扮演着非常重要的角色。糖苷酶作为一类重要的化合物,在食品、医疗、工业等领域都有着十分广泛的利用价值[3-7]。但目前已知存在的糖苷酶大多数都存在酶活力低的问题,且该酶来源十分匮乏。因此,寻找天然产耐有机溶剂糖苷酶的微生物显得尤为重要。本实验采用含有机溶剂的培养基,筛选能产耐有机溶剂糖苷酶的微生物,并对所得微生物进行生物学鉴定,优化产酶条件,为进一步的研究和应用提供酶源和基础数据。
  1 材料与方法
  1.1 材料
  1.1.1 主要设备与材料
  台式高速冷冻离心机,德国希格玛离心机有限公司,singma3K15型;PCR自动系列化分析仪,德国耶拿分析仪,Tpersonal型;琼脂糖水平电泳仪,北京市六一仪器厂,DYCP-32A型。
  浙江台州路桥某家化工企业所排污水长期污染过的土样。羧甲基纤维素钠(CMC-Na)、N,N-二甲基甲酰胺(DMF)、对硝基苯酚-p-D-葡萄糖苷、HEPES。
  1.1.2 培养基
  富集培养基:羧甲基纤维素钠(CMC-Na)10.0 g/L,DMF 5%,胰蛋白胨25.0 g/L,酵母提取物3.0 g/L,NaCl 5.0 g/L,K2HPO4 3.0 g/L,KH2PO4 1.0 g/L,微量元素液100 mL/L(MgSO4·7H2O 0.3g,FeSO4·7H2O 0.005 g,CaCl2 0.005g,溶于100 ml蒸馏水中),pH 7.0。
  初筛培养基:将富集培养基中的胰蛋白胨替换成 (NH4)2SO4 5.0 g/L。
  复筛液体培养基:羧甲基纤维素钠(CMC-Na)10.0 g/L,蛋白胨 3.0 g/L,酵母提取物2.0 g/L,DMF 5%,(NH4)2SO4 5.0 g/L,NaCl 5 g/L,K2HPO4 3 g/L,KH2PO4 1.0 g/L,微量元素溶液100 mL/L,pH 7.0。
  1.2 方法
  1.2.1 富集培养
  将采集的土壤悬浮在装有90 mL已灭菌的生理盐水的锥形瓶中,在180 r/min,30 ℃条件下的摇床中震荡30 min,取部分菌液转移到富集液体培养基进行培养,然后重复转接2次。
  1.2.2 初筛
  选择有明显的微生物生长的富集培养液,取部分富集培养液涂布于初筛固体培养基上,30 ℃恒温箱中培养24 h,观察平板上微生物生长情况。
  1.2.3 复筛及酶活测定
  从初筛培养基中挑取明显生长的单菌落于复筛液体培养基中培养,然后取菌悬液离心收集菌体,再用等体积的50 mM HPPES(pH7.0)缓冲液重悬,制得菌悬液,以对硝基苯酚葡萄糖苷为底物,测其糖苷酶活力大小。
  1.2.4 菌种鉴定
  分离纯化菌种,观察纯种菌种的菌落形态,包括菌落大小,颜色,湿度,边缘等;用革兰氏染色,用显微镜观察细菌形态;根据试剂盒提取基因组DNA,然后进行PCR扩增(50μl的体系:去离子水21μl,PrimeSTAR MAX Premix 25 μl,基因组1μl,引物pF-rRNA和pR-rRNA各1.5 μl),琼脂糖凝胶电泳检测PCR结果。接着对PCR产物割胶回收,利用割胶回收试剂盒纯化基因组以及回收基因组。最后,进行测序,在基因库进行比对,制作进化树。
  2 实验结果与分析
  2.1 微生物鉴定
  2.1.1 形态鉴定
  对微生物进行革兰氏染色,并在显微镜下观察其染色情况以及形态,实验结果如图1所示,微生物革兰氏染色呈紫色,所以该微生物属于革兰氏阳性菌,并且微生物的形态呈杆状,杆状比较短,属于短杆菌类。
  2.1.2 分子生物学鉴定
  通过提取基因组,再进行PCR,琼脂糖凝胶电泳后进行割胶回收纯化基因,并将片段收回用于测序。经过序列比对,得出该微生物的生长进化树如图2所示。经过序列比对得出该微生物与Enterobacter cloacae(阴沟肠杆菌)一类序列最为接近。
  2.2 微生物产酶性质研究
  2.2.1 反应温度对酶活力的影响
  对于反应温度进行优化,分别考察了20、25、30、35、37、40 ℃条件下微生物ZXS的产酶活力,每个条件都进行3次平行重复试验。结果如图3(A)所示,随着反应温度的不断升高,该酶活力先升高达到最大值后再降低,其中在温度为35 ℃时产酶效果最佳。
  2.2.2 反应体系pH值对酶活力的影响
  对于反应体系中的pH进行优化,分别在pH为5.0、6.0、7.0、8.0、9.0、10.0的条件下进行考察,每个条件进行3次平行重复试验,再检测微生物ZXS的产酶活力。结果如图3(B)所示,随着pH的变化酶活力也在不断地变化,总体趋势是随着pH的不断增大,酶活力呈现上升趋势,其中pH为7.0和10.0时酶活力达到最高,接近相等,所以该菌株在一定程度上具有耐受碱性能力,并且在pH 5.0~10.0之间时,此酶的催化活力都相对较稳定。   2.2.3 DMF浓度对酶活力的影響
  对于反应体系中有机溶剂试剂DMF的含量进行考察,分别选取了不含DMF试剂,含5%、10%、15%、20%DMF的反应体系进行反应,每个条件进行3次平行重复试验,再检测微生物ZXS的产酶活力。结果如图3(C)所示,随着DMF浓度的升高,菌株的产酶性能逐渐减弱,但并没有完全抑制酶活力,所以总体上DMF对该酶的酶活力有一定的抑制作用。
  2.2.4 不同有机溶剂对酶活力的影响
  对于微生物ZXS的耐有机溶剂性能进行考察,在反应体系中分别含有10%的DMF、二甲基亚砜(DMSO)、无水乙醇的条件下进行催化反应,每个条件进行3次重复试验,再检测微生物ZXS的产酶活力。结果如图3(D)所示,该菌株在相同条件下对二甲基亚砜的耐受力更好,对无水乙醇的耐受力最差。
  3 结语
  本实验筛选得到1株产耐有机溶剂糖苷酶的微生物,命名为ZXS,属于Enterobacter cloacae(阴沟肠杆菌)类革兰氏阳性菌株。该菌株在无有机溶剂的情况下酶活最高达到40.2U/L。经进一步对其产酶条件的优化,菌株培养8h后,在反应温度为35℃,pH为7.0,DMF含量为5%时,酶活力最高达到25.9U/L。
  参考文献
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