人参LCAT基因的生物信息学分析及其转化胡萝卜

来源 :基因组学与应用生物学 | 被引量 : 0次 | 上传用户:youling0186
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本研究对人参卵磷脂甾醇酰基转移酶基因(PgLCAT)进行生物信息学分析,以胡萝卜为受体进行遗传转化。根据已筛选的PgLCAT基因序列,利用ProtParam、ExPASy等生物信息学在线软件对PgLCAT核酸和蛋白质序列进行基本分析;使用R语言、BioLayout Express3D等软件对PgLCAT基因的表达模式进行分析;设计PgLCAT引物,以人参总RNA反转录得到的cDNA为模板,进行PCR扩增,并构建克隆载体与表达载体,进行胡萝卜转化。结果显示,PgLCAT基因长度为1 438 bp,完整开放阅读框(ORF)的长度为1 371 bp,编码457个氨基酸,相对分子质量为51 473.00 kD,理论等电点为5.43,是无跨膜结构且不编码信号肽的亲水性蛋白,PgLCAT在人参14个组织部位的叶片中表达较高,其表达模式与人参皂苷的生物合成紧密相关,显著(p<0.01)影响人参单体皂苷Rb1和总皂苷的生物合成;成功构建表达载体,转化胡萝卜并获得了转基因阳性植株。为深入研究PgLCAT基因的功能及其对人参皂苷生物合成机制的研究提供了科学依据。
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