【摘 要】
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目的 对青海省2013年手足口病(Hand,Foot and Mouth Disease; HFMD)的病原谱和人肠道病毒A组71型(Human Enterovirus Group A Type 71,HEVA71)的基因特征进行分析.方法 对青
【机 构】
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中国疾病预防控制中心病毒病预防控制所,卫生部医学病毒学和病毒病重点实验室,世界卫生组织西太平洋区脊髓灰质炎参比实验室,北京102206;青海省疾病预防控制中心,西宁,810007
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目的 对青海省2013年手足口病(Hand,Foot and Mouth Disease; HFMD)的病原谱和人肠道病毒A组71型(Human Enterovirus Group A Type 71,HEVA71)的基因特征进行分析.方法 对青海省2013年送检的HFMD标本,用荧光定量逆转录-聚合酶链反应(Reverse Transcription-Polymerase Chain Reaction,RT-PCR)方法进行筛查,对HEVA71阳性标本进行病毒分离,对分离到的病毒提取核酸,用RT-PCR方法对VP1编码区进行扩增及核苷酸序列测定和整理分析,并与HEVA71各基因型和基因亚型的代表株序列构建亲缘关系进化树.结果 对青海省2013年分离的62株HEVA71进行VP1编码区核苷酸序列测定后,分析发现它们在VP1编码区核苷酸水平和氨基酸水平的同源性分别为95.5％ ～ 100.0％和99.0％～100.0％.与其他各基因型和基因亚型的HEVA71代表株构建的亲缘进化树中显示,青海省HEVA71分离株与C4亚型代表株聚为一簇,属于C4基因亚型C4a进化分支.与2008年、2012年在青海省分离的HEVA71在核苷酸和氨基酸水平的同源性分别为95.8％～97.5％和99.0％～99.7％.结论 2013年,C4a亚型HEVA71在青海省持续传播并占有绝对优势,且存在两条传播链的流行.
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