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放线菌药物的开发已取得了极其辉煌的成就，对医疗事业的发展和人类健康做出了重大贡献。然而，随着放线菌药物资源的长期开发和利用，也面临诸多问题。如：包袱沉重，去重复难度极大，因而投资周期长、耗资巨，风险大；药物开发赶不上病原菌抗药性的增加及不断出现的新疾病；虽然未知放线菌甚多，但发现难度大。为此，提出了从化学、菌种和基因三方面开展放线菌药物研究的应对策略，以解决限制放线菌药物资源持续利用和发展的瓶颈。