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采用分子动力学模拟（MD）方法研究了无定形二氧化硅的结构和表面性质。模拟过程首先采用熔融-淬火的方法进行，模拟得到的无定形二氧化硅的径向分布函数以及取向分布与文献是一致的。比较了直接破裂该结构得到无定形二氧化硅表面和采用分子动力学模拟对表面进行高温柔性化得到的无定形二氧化硅表面间的区别。结果表明，直接切割得到无定形二氧化硅表面，接近实验中水热合成法得到的亲水的无定形二氧化硅表面；采用动力学模拟对表面进行高温柔性化得到的无定形二氧化硅表面，接近于真实实验干氧氧化得到憎水的无定形二氧化硅表面。