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Southern印迹结果证明在CFA/II阳性菌E44815的诸多质粒中，编码CS3纤毛抗原的质粒为一约为60 MD的大质粒；当这些质粒用Hind Ⅲ消化时，该抗原的编码基因位于5.0kb的DNA片段上。回收该片段并插入到载体质粒pBR322的Hind Ⅲ位点，构建了E. coli E44815株质粒的有限基因库。通过筛选，获得了两种插入方向的阳性重组子。全细胞ELISA测定结果表明，只有当插入片段的转录方向和载体质粒中的P1启动子的转录方向一致时，重组质粒才能有效地表达CS3纤毛抗原；宿主不同时表达水平存在一定差异。SDS-PAGE及Western印迹试验表明：CS3纤毛抗原有两种不同的单体形式，分子量大约分别为15.0kD和15.5kD。CS3纤毛抗原编码基因的克隆为研究CS3基因表达调控和研制预防ETEC腹泻疫苗打下了基础。