生物信息学方法筛选华支睾吸虫成虫功能基因——钙调神经磷酸酶B亚基样蛋白

来源 :中国生物制品学杂志 | 被引量 : 0次 | 上传用户：libolb666

【摘要】

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目的本文通过建立华支睾吸虫成虫cDNA文库,筛选其功能基因.方法应用SMART方法构建华支睾吸虫成虫cDNA文库,进行大量EST测序,然后应用生物信息学方法将EST序列与GenBank中登陆

【作者】

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张红梅余新炳徐劲吴忠道

【机构】

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深圳市东湖医院深圳市肝病研究所,中山大学医学院病原学教研室

【出处】

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中国生物制品学杂志

【发表日期】

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2005年4期

【关键词】

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生物信息学筛选华支睾吸虫成虫功能基因钙调神经磷酸酶B亚基样蛋白 EST Clonorchis sinensis cDNA library EST Ca

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目的本文通过建立华支睾吸虫成虫cDNA文库,筛选其功能基因.方法应用SMART方法构建华支睾吸虫成虫cDNA文库,进行大量EST测序,然后应用生物信息学方法将EST序列与GenBank中登陆的序列进行同源性比对、序列拼接及基因完整性判断;并应用NCBI上的RPSBLAST对所筛选基因的保守域进行搜索比对,利用PredictProtein分析、预测其功能域及二级结构.结果从华支睾吸虫成虫cDNA文库中筛选的钙调神经磷酸酶B亚基样蛋白(CsCBLP)基因,经同源性分析,CsCBLP与褐家鼠钙调神经磷酸酶(Ca

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