【摘 要】
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目的 探讨125 I放射性粒子辐射诱导人肝癌细胞(Hep3B)长链非编码RNA(lncRNA)表达谱的变化.方法 采用Illumina PE150平台对125 I放射性粒子辐照和未经辐照的Hep3B细胞进行lncRNA测序,对原始数据进行lncRNA表达量、差异lncRNA、GO功能富集等生物信息分析;选取表达差异显著的lncR-NAs,设计引物进行实时荧光定量聚合酶链式反应(qRT-PCR)验证测序结果.结果 实验中得到9206个差异lncRNAs转录本,其中上调4556个,下调4650个;6个表达差异
【机 构】
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重庆市红十字会医院/江北区人民医院放射科 重庆 400020;重庆市大足区妇幼保健院放射科,重庆 402360;陆军军医大学第一附属医院核医学科,重庆 400038
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目的 探讨125 I放射性粒子辐射诱导人肝癌细胞(Hep3B)长链非编码RNA(lncRNA)表达谱的变化.方法 采用Illumina PE150平台对125 I放射性粒子辐照和未经辐照的Hep3B细胞进行lncRNA测序,对原始数据进行lncRNA表达量、差异lncRNA、GO功能富集等生物信息分析;选取表达差异显著的lncR-NAs,设计引物进行实时荧光定量聚合酶链式反应(qRT-PCR)验证测序结果.结果 实验中得到9206个差异lncRNAs转录本,其中上调4556个,下调4650个;6个表达差异较大基因的qRT-PCR验证结果与测序结果一致,显示测序结果可靠;生物信息分析发现差异lncRNAs转录本的靶基因功能主要集中在自噬体形成、DNA损伤等方面,主要参与细胞增殖的调控.结论 125 I放射性粒子诱导肝癌Hep3B细胞lncRNA表达谱发生变化,为进一步探索电离辐射诱导肿瘤细胞死亡分子机制、寻找放疗生物标志物和干预靶点提供了新思路.
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