【摘 要】
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目的 从GEO数据库中选择GSE55267基因表达谱,旨在寻找滤泡性淋巴瘤的核心基因(Hub基因),研究相关的发病机制,以发现新的诊断和治疗靶标.方法 选取GEO数据库中GSE55267基因表
【机 构】
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新疆医科大学第一附属医院,乌鲁木齐,830054;新疆医科大学,乌鲁木齐,8300173;石河子大学医学院第一附属医院,石河子大学医学院,新疆地方与民族高发病教育部重点实验室,新疆,石河子,83200
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目的 从GEO数据库中选择GSE55267基因表达谱,旨在寻找滤泡性淋巴瘤的核心基因(Hub基因),研究相关的发病机制,以发现新的诊断和治疗靶标.方法 选取GEO数据库中GSE55267基因表达谱,纳入69例样本,包括滤泡性淋巴瘤63例,正常B细胞样本6例.利用GEO2R在线工具筛选出差异表达基因(DEGs),利用DAVID数据库进行GO和KEGG通路分析,并基于STRING数据库对DEGs进行蛋白质的PPI网络构建.结果 筛选出776个DEGs,其中198个下调基因,578个上调基因.下调基因在转录负调控,MAPK信号通路等富集,上调基因主要参与细胞黏附和局灶黏附功能.前15个连接程度高的基因作为Hub基因,包括TNF,IL6,JUN,FOS,MMP9,IGF1等,这些Hub基因可能与滤泡性淋巴瘤的发生发展有关.结论 生物信息学分析表明,DEGs和Hub基因可能作为一种新的生物标志物用于诊断和指导滤泡性淋巴瘤的联合用药.
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