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【摘 要】
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基于多平台基因表达数据挖掘水稻胁迫相关基因,可增加关键基因预测的可靠性,获得更具普适意义的结果。本研究从NCBI数据库中收集了与水稻非生物胁迫相关的94份affymetrix基因芯片数据和42份RNA-seq转录组数据。首先对同一类型同一胁迫相关的多个数据集以数据转换法融合,得到干旱胁迫相关的affymetrix数据集D_affy和RNA-seq数据集D_rnaseq,盐胁迫相关的affymetrix数据集S_affy和RNA-seq数据集S_rnaseq;接着对4个数据集分别基于Pearson线性相关系
【机 构】
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湖南农业大学信息与智能科学技术学院,湖南农业大学/湖南省农业大数据分析与决策工程技术研究中心
【出 处】
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作物学报
【发表日期】
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2021年12期
【基金项目】
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湖南省教育厅科学研究重点项目(18A105),长沙市工业科技特派员项目(201845),湖南农业大学“双一流”建设项目(SYL2019075)资助。
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