【摘 要】
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D2蛋白是植物光系统Ⅱ复合体（PSⅡ）核心蛋白之一，由叶绿体psbD基因编码。为了深入理解核心薄囊蕨类植物在阴生环境下的“辐射”式演化，我们对12种蕨类植物的psbD基因进行了克隆和
【机 构】
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中国科学院植物种质创新与特色农业重点实验室,中国科学院大学,中山大学生命科学学院
【基金项目】
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国家自然科学基金资助项目(31070594);湿地演化与生态恢复湖北省重点实验室开放课题
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D2蛋白是植物光系统Ⅱ复合体（PSⅡ）核心蛋白之一，由叶绿体psbD基因编码。为了深入理解核心薄囊蕨类植物在阴生环境下的“辐射”式演化，我们对12种蕨类植物的psbD基因进行了克隆和测序，然后联合已公布的其他8种蕨类植物的psbD序列，基于ω值（非同义替换率ds和同义替换率ds的比值）探讨了该基因经受的选择压力。发现D2蛋白在大多数分支和位点受到强烈的负选择，但是树蕨类分支的psbD进化速率低且ω值较高。借助多种模型进行的共进化分析显示，树蕨类D2蛋白的168R、245H和272M两两组成具有共进化关系的
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