【摘 要】
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目的研究我国结核分枝杆菌复合群(MTBC)抗原mpt83、mpt70、lpqH、pstS3、groES及其人B细胞表位的多态性。方法从中国疾病预防控制中心传染病所结核室菌株库随机选取我国的179株MTBC临床分离株,培养后提取DNA,基因扩增并测序,根据H37Rv标准序列和免疫表位数据库(IEDB)的抗原表位信息,比较、分析各基因B细胞表位序列的变异情况,最后用MEGA6软件计算各基因的非同义突变
【机 构】
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421000 湖南省衡阳市南华大学病原生物学研究所,传染病预防控制国家重点实验室 传染病诊治协同创新中心 中国疾病预防控制中心传染病预防控制所,421000 湖南省衡阳市南华大学病原生物学研究所,中国
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目的研究我国结核分枝杆菌复合群(MTBC)抗原mpt83、mpt70、lpqH、pstS3、groES及其人B细胞表位的多态性。
方法从中国疾病预防控制中心传染病所结核室菌株库随机选取我国的179株MTBC临床分离株,培养后提取DNA,基因扩增并测序,根据H37Rv标准序列和免疫表位数据库(IEDB)的抗原表位信息,比较、分析各基因B细胞表位序列的变异情况,最后用MEGA6软件计算各基因的非同义突变率(dN)、同义突变率(dS)及其比值。
结果在179株MTBC菌株中,mpt83基因有7个单核苷酸多态性(SNP)位点,该基因及其表位区、非表位区的dN/dS分别为0.88、0.34和0.14;mpt70基因有1个SNP位点,为非同义突变;lpqH基因及其B细胞表位区dN/dS均为0.38,非表位区dN、dS均为0;pstS3基因及B细胞非表位区的dN/dS分别为1.74和1.40;groES基因未发现突变位点。
结论结核分枝杆菌mpt83、lpqH、pstS3的基因序列及B细胞表位具有较高的多态性,而mpt70和groE基因B细胞表位较保守。
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