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目的 对自贡市2012 2016年临床分离44株疑似非结核分枝杆菌进行菌种鉴定.方法 使用PCR-荧光探针法对自贡市临床44份疑似非结核患者的菌株进行初步筛查,并对44份菌株的hsp65及rpoB基因进行扩增并测序,通过序列比对获得菌株型别.结果 44株菌株分枝杆菌经PCR-荧光探针法检测结果显示均为非结核分枝杆菌.对44株分枝杆菌进行hsp65及rpoB基因测序比对,进一步菌种鉴定结果显示,44株分枝杆菌分别为11种非结核分枝杆菌.结论 自贡市非结核分枝杆菌种类较多,44株菌即分为11个种.PCR荧光探针法及基因测序法可对临床非结核分枝杆菌进行快速、准确的鉴定.