【摘 要】
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在对部分已知基因序列与EST数据库比对搜索的匹配结果进行深入分析的基础上, 总结出了匹配程度检验、Gap检验、包含性检验、长度检验等多种措施对EST匹配结果的真假进行判别,
【机 构】
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华中科技大学生物信息技术研究中心,武汉,430074
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在对部分已知基因序列与EST数据库比对搜索的匹配结果进行深入分析的基础上, 总结出了匹配程度检验、Gap检验、包含性检验、长度检验等多种措施对EST匹配结果的真假进行判别, 并研制出了相应的分析软件EDSAc1.0, 用于从基因序列的众多EST匹配中尽可能地筛选出真正相关的匹配. 在此基础上, 该软件可进一步鉴定出基因序列中的外显子区域. 用标准测试数据集HMR195中的人类基因序列对其性能进行测试时, EDSAc1.0鉴定出的蛋白编码区在核苷酸水平上的专一性Sp达到了0.997, 敏感度Sn达到了0.88, 优于对国际同类软件TAP的对比测试结果. EDSAc1.0已提供网上服务(http://infosci.hust.edu.cn).
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