鱼种优劣对渔业生产影响极大，可从以下几个方面来鉴别鱼种的优劣。
　　一、规格形态
　　同类型鱼种规格均匀，体质健壮，背高肉厚，为优质鱼种；反之，体质瘦弱，干瘪，个体小，头大尾细，身体呈刀背形，体质差，成活率低，则为劣质鱼种。
　　二、体表色泽
　　鱼种质量优劣在体色上有明显的反映，优质鱼种色泽鲜明，且不同种类的优质鱼种体色有所不同。青鱼体色呈灰白色，越健壮的鱼种，其体色越淡；草鱼体色呈淡金黄色，灰黑色网纹鳞片明显，越健壮的鱼种，金黄体色越显著；白鲢背部银灰色，腹部银白色，越健壮的鱼种，其银白色越光亮；鳙鱼体色呈金黄褐色，两侧有黑色斑点，越健壮的鱼种，黑色越淡，金黄色越显著。凡是体色发黑、灰暗、失去光泽的鱼种，都是不健康的劣质鱼种。鱼种优质健壮，则其体表有一层黏液，用以保护鳞片和皮肤免受病菌侵袭；而病弱鱼种缺乏黏液。也有些病魚体表黏液多，体表无光泽，俗称鱼体“发毛”。如鱼种体色度深或呈乌黑色，则是瘦鱼或病鱼。
　　三、活动能力
　　健壮鱼种游动活泼，逆水性强，在网箱或活水密集囤养时鱼种头部朝下，仅能看到鱼尾在摆动，将鱼种放入脸盆等容器中，健壮鱼种尾鳍扭曲及弹跳力强。优质鱼种鳃盖骨紧闭。当鱼种从车箱中刚捞出来时，跳动敏捷有力，说明鱼种体质好；如果捞出时，鱼种绵软无力、不跳动，说明鱼种体质较差。
　　导致鱼种柔弱、无力，主要有两个方面的因素：一是停食过早，鱼种体质瘦弱，这种鱼头大、躯干瘦瘪无肉、尾柄细长。二是因低氧昏迷或二氧化碳中毒导致昏迷。低氧昏迷多发生于短途运输，因为供氧不足而昏迷。这种鱼在低氧昏迷时间较短时，放入大塘后，很快就能恢复到正常状态；如果昏迷时间过长，就会造成鱼种大量死亡。二氧化碳中毒昏迷多发生于长途密封箱运输，当水体中的二氧化碳浓度过高时，就会大量进入鱼体血液中，导致鱼种血液pH值降低，血红蛋白载氧能力下降，严重时会导致鱼类昏迷甚至死亡。二氧化碳中毒的鱼，处于轻度昏迷状态时，放入大的水体后，需要几分钟才能恢复到正常状态；处于深度昏迷时，一般很难恢复甚至完全不能恢复。
　　四、体表特征
　　鱼种正常体表特征是体表丰满，无畸形，无歪体，鳞片完整，鳍条无损，鱼体长度与重量成一定比例。优质鱼种规格大，成活率高，生长快，鱼体光滑、圆润，鱼种皮肤正常。如果鱼体表皮粗糙、刺手，说明鱼种体表黏液较少或消失。一旦失去黏液的保护，鱼体更容易受伤，并易被病原体感染；失去黏液的屏障，外界水分会透过鱼的皮肤大量渗入鱼体，使鱼体内渗透压失衡，鱼种成活率大大下降。
　　五、病害控制
　　到了冬季，有些病原体完全死亡消失，有些潜伏于鱼体，并由鱼种带入并传播，如锚头鳋、指环虫、车轮虫、鳃隐鞭虫、黏孢子虫等。寄生于鱼体表的锚头鳋，肉眼可见；寄生于鳃丝上的指环虫、车轮虫、鳃隐鞭虫等，可借助于显微镜进行检测；寄生于肠道中的寄生虫或细菌，须对肠道进行解剖。还有些病原体，如黏孢子虫、细菌、病毒等，须对鱼种来源地进行调查，严禁从疫区引进鱼种。所有鱼种在放养前，必须根据检测结果，选用相应的药物进行预防。
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