酰胺生物降解机制的分子模拟研究

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为探索酰胺生物降解酶的微观降解机制,用分子对接的方法模拟了酰胺与酰胺酶的相互作用,得到其复合物结构的理论模型,根据打分函数最低原则筛选出的Rh Amidase与L-Methioninamide之间最佳构象打分函数为-86.741 9,二次打分函数为-76.022 4。同时,应用LPC/CSU Server研究了最佳构象的相互作用情况,结果表明,酰胺与酰胺酶之间以疏水作用数量最多,酰胺酶的ARG256 A、LEU353 A、TYR346 A、ARG225 A、THR218 A和PRO222 A在催化过程中起
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