2016—2017年深圳市龙华区诺如病毒疫情流行特征及病原学特点

来源 :国际病毒学杂志 | 被引量 : 0次 | 上传用户:wildboar2009
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目的

分析深圳市龙华区诺如病毒疫情流行特征及病原学特点。

方法

选取2016年10月—2017年9月期间深圳市龙华区共6个街道(观湖、民治、龙华、大浪、福城和观澜)29起聚集性胃肠炎疫情中的317例疑似病例作为研究对象。收集研究对象肛拭子标本,共计317份,采用荧光定量PCR方法对样品进行诺如病毒检测,阳性样本进一步用逆转录PCR法同时对聚合酶区-衣壳区进行基因扩增,并进行测序和进化分析以鉴定其基因型。

结果

317例疑似病例中,实验室确诊156例,其中5岁以下儿童99例(63.46%,99/156)。29起聚集性胃肠炎疫情报告单位主要为幼儿园,占75.9%(22/29)。在317份标本中,156份为诺如病毒GⅡ核酸阳性,阳性率为49.21%。未检出诺如病毒GⅠ。对156份诺如病毒GⅡ核酸阳性的标本进行聚合酶区-衣壳区序列逆转录PCR扩增,共82份阳性,获得82株毒株序列。系统发生树构建结果发现,2016年10月—2017年9月期间,引起深圳市龙华区诺如病毒疫情的基因型有4种,包括GⅡ.P16-GⅡ.2、GⅡ.Pe-GⅡ.4 Sydney 2012、GⅡ.P17-GⅡ.17和GⅡ.P12-GⅡ.3。其中,GⅡ.P16-GⅡ.2引起的有18起,占62.1%(18/29)。

结论

深圳市龙华区应进一步加强诺如病毒聚集性疫情监测,重点关注幼儿园5岁及以下儿童,并且要重点监测是否有变异株出现。

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