【摘 要】
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目的 建立中国HBV B、C基因型参照序列.方法 从GenBank中获得来源于中国不同地区的HBV全基因序列.通过基因分型和序列比对,以相同位置频率最高碱基作为参照碱基建立序列;将这
【机 构】
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安徽医科大学附属第一医院感染科,合肥,230022;德国Essen大学病毒学研究所;华中科技大学同济医学院附属同济医院临床免疫室
【基金项目】
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国家自然科学基金;安徽省教育厅基金
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目的 建立中国HBV B、C基因型参照序列.方法 从GenBank中获得来源于中国不同地区的HBV全基因序列.通过基因分型和序列比对,以相同位置频率最高碱基作为参照碱基建立序列;将这些参照序列与国内外的参照序列进行比较,了解其中的不同点,对不同编码区的氨基酸序列进行比较.对B,C基因型HBV的碱基替代情况进行统计学分析,其中1762、1764、1896位点采用χ~2检验,1858位点采用Fishers确切概率法检验. 结果获得了中国HBV B,C基因型参照序列.Bc与Ba、Bj基因型HBV的全基因序列同源性分别为99.32%,95.52%,S基因序列同源性分别为99.71%、98.68%; Cc与C、Caus基因型的全基因序列同源性分别为98.44%、93.97%,S基因序列同源性分别为99.27%、95.01%.与Bj型相比.Bc和Ba型同源性更高;与Caus型相比,Cc和C型同源性更高.不同编码区的氨基酸序列也有差异;两种基因型在1762、1764、1858位点的碱基分布差异均有统计学意义(P值均
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