论文部分内容阅读
目的
观察大鼠心力衰竭细胞中microRNA (miRNA)表达变化，利用生物信息学分析技术探索差异miRNA靶基因的功能。
方法18只成年雄性SD大鼠，体质量200～220 g，随机数字表法随机分为两组：正常对照组(CON组)和心力衰竭组(HF组)。HF组制备阿霉素致心力衰竭模型，CON组注射等量生理盐水。提取大鼠心脏，Largendorff逆行灌注法分离心室肌细胞，提取总RNA行miRNA表达谱检测，筛选两组差异表达的miRNA，荧光定量RT- PCR技术验证结果，Targetscan、miRanda软件预测差异表达miRNA的靶基因，并对靶基因行生物信息学分析。
结果芯片检测结果显示，与CON组相比，HF组共有37个miRNA表达发生显著改变，其中22个miRNA上调，15个miRNA下调(均P<0.01，FDR<0.05)。荧光定量RT- PCR检测miR-133b-5p (t＝14.56，P<0.1)、miR-6216 (t＝9.32，P<0.1)、let-7e-5p (t＝13.92，P<0.1)表达水平，变化趋势与芯片结果一致。生物信息学分析显示，差异表达miRNA调控的靶基因显著富集于31个基因组(均P<0.01，FDR<0.05)和12条信号通路(均P<0.05，FDR<0.05)，其中泛素蛋白酶体系统、MAPK信号通路、Toll样受体信号通路富集程度较高。
结论阿霉素诱导的心力衰竭模型大鼠心肌细胞中miRNA表达谱发生显著改变，这些差异表达miRNA可能通过调控靶基因功能参与心力衰竭的病理生理过程。