基于Illumina Miseq分析黄精根腐病根际土壤真菌群落结构及多样性

来源 :世界科学技术:中医药现代化 | 被引量 : 0次 | 上传用户：cs8613416

【摘要】

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目的研究患根腐病和健康黄精的根际土壤真菌群落结构组成、丰富度和多样性变化情况,为查明黄精根腐病发生机制提供线索。方法以4年生黄精根腐病根际土壤(GG组)、4年生健康黄

【作者】

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卢圣鄂肖波任风鸣卓维黄红燕

【机构】

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重庆市药物种植研究所

【出处】

：

世界科学技术:中医药现代化

【发表日期】

：

2021年1期

【关键词】

：

黄精根腐病微生物群落高通量测序 α-多样性 Polygonatum sibiricum Root rot Microbial community

【基金项目】

：

重庆市科技局科研机构绩效激励引导专项(基本科研业务费)(cstc2019jxjl-jbky0011):重庆黄精根腐病发生与根际土壤微生物群落结构变化关系研究,负责人:卢圣鄂,重庆市科技局科研机构绩效激励引导专项(基本科研业务费)(17JK01-1812-4):独蒜兰共生菌和促生菌根真菌的分离筛选及促生作用的研究,负责人:卢圣鄂

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目的研究患根腐病和健康黄精的根际土壤真菌群落结构组成、丰富度和多样性变化情况,为查明黄精根腐病发生机制提供线索。方法以4年生黄精根腐病根际土壤(GG组)、4年生健康黄精根际土壤(GJ组)和未种过黄精的土壤(GK组)为研究对象,采用Illumina Miseq技术分析土壤真菌群落结构组成。结果 9个土壤样品基因组共获得有效ITS1序列1063335条,病株组土样真菌OTUs数显著少于健康组和空白组土样。种群多样性指数显示病株组最低,空白组最高,在门分类水平上,患根腐病组及健康组土样的主要优势菌群均为子囊菌门

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